Dez anos depois da invasão de Naboo, a galáxia está à beira de uma guerra civil. Sob a liderança do Conde Dooku, o Jedi renegado, centenas de sistemas solares ameaçam abandonar a República Galáctica. Quando a Senadora Padmé Amidala, antiga rainha de Naboo, é vitima de uma tentativa de assassinato, Anakin Skywalker, o discípulo de Jedi, é destacado para a proteger. Durante a sua missão, Anakin descobre o seu amor por Padmé e também o seu lado negro. Em breve, Anakin, Padmé e Obi-Wan Kenobi são arrastados para o seio do movimento Separatista e para o início do Ataque dos Clones.